为了从源头上断绝污染源，我市实施水环境达标工程，加快污水处理厂及配套管网建设。主城区累计建成城市污水处理厂17座，小城镇污水处理厂68座，污水处理总能力达到175万吨/日，实现了建成区和建制镇污水处理设施全覆盖。开展次级河流综合整治，截止今年6月，累计投入65亿元，完成1403个工程项目5800余个子项目，21条河流均达到水域功能要求或消除黑臭。加大工业污染防治力度，推进工业企业园区化，实现工业企业污染物稳定达标排放。
实施畜禽养殖污染整治，减少农业源污染物排放。市政府明确规定二环内禁止养殖，并限期进行取缔。2010年以来，主城区共取缔和搬迁各类养殖场（户）1797家，彻底解决了畜禽养殖对水环境的污染。
而在饮用水供水方面，我市调整优化供水结构，提升治水工艺水平。我市整合供水资源，成立了重庆水务资产投资公司和重庆水利投资有限公司两大公司统筹主城区供水，解决了供水多元化管理格局。同时，对水质风险等级高或富营养化风险等级高、受有毒污染风险等级中级以上，以及取水量在1.5万吨以下的小型水厂实施关闭，将其供水区域纳入城市公共供水范围。此外，提高饮水质量，为达到国家生活饮用水卫生标准，市自来水公司先后投入2000余万元资金，添置气相色谱仪、原子荧光分析仪等先进检测设备，完成了30多个水质参数方法能力验证。
